Pemilihan WaKa MTsN 2 Purworejo berlangsung layaknya pemilihan umum legislatif dan pemilihan umum presiden. Bahkan, warga madrasah siap menagih apabila kepemimpinan WaKa MTsN 2 Purworejo yang baru tidak amanah.
Berada tepat di balai kantor guru MTsN 2 Purworejo, pelaksanaan pemilihan dilaksanakan. Antusiasme warga madrasah yang terdiri dari para guru, karyawan dan penjaga madrasah layaknya proses pencoblosan. Seluruh civitas akademik madrasah menandatangani daftar hadir dan mendapatkan kertas suara yang kemudian memilih calon yang telah ditetapkan oleh panitia pemilihan.
Hasil pemilihan waka dari unsur guru Bahasa Inggris berturut-turut Farida Nur Aini, M. Pd mendapatkan 25 suara, Nuning Kurniasih, M. Pd: 28 suara, dan Wahyuningsih, S. Pd: 9 suara. Guru Matematika; Supriyo, M. Psi: 13 suara, Erni Catur Ning Rahayu, S. Pd: 19 Suara dan Kun Munahsiroh, S. Pd: 30 Suara. Perwakilan dari guru IPS, Mujtahidah, S. Pd: 2 suara, Rahtyan Dwi Wiyoko, S. Pd: 51 suara dan Ida Musrifah, S. Pd: 4 suara.
Pemilihan tersebut memilih 3 Waka, Sehingga terpilih (1) Nuning Kurniasih, M. Pd., (2) Kun Munahsiroh, S. Pd., dan (3) Rahtyan Dwi Wiyoko, S. Pd. Ketiganya akan mendapatkan Amanah menjadi Waka MTsN 2 Purworejo yang baru. Ketua panitia pemilihan, Hartono, A. Md. Selaku Kepala TU MTsN 2 Purworejo berpesan agar para waka terpilih menjalankan tugasnya dengan baik dan melanjutkan kinerja waka terdahulu yang sudah baik. Waka terpilih juga menanggung beban yang tidak ringan karena MTsN 2 Purworejo merupakan salah satu madrasah favorit yang senantiasa harus menjaga nama baik madrasah. Namun, dengan niat yang ikhlas dan kerja yang penuh semangat maka semua hal akan dapat dikerjakan dengan baik pula.
